<li>
  <input type="checkbox" <?= $todo->is_done ? 'checked' : ''; ?>>
  <span class="<?= $todo->is_done ? 'done' : ''; ?>">
    <?= h($todo->title); ?>
  </span>
</li>

こちらの input タグと span タグの中の $todo->is_done には h() 関数を使う必要がないのですか？