動画では、経過時間を分単位までですが、時間まで表記させたいと思い、

const h = String(d.getHours()).padStart(2,'0');

を追加し

timer.textContent = `${h}:${m}:${s}.${ms}`;

としました。

スタートすると09：00：00：00　からカウントが始まり、タイムゾーンの問題かと思い、無理やり

const h = String(d.getUTCHours()).padStart(2,'0');

にしたところ見た目には問題ない感じがしました。

しかし、

startTime = Date.now();　でstartTimeとDate.now()

が同じ値になっていると思ったのですが、

const d =new Date(Date.now() - startTime + elapsedTime);

上の式で時差が出てしまう事がうまく腑に落ちません。

そもそも私の考え方が間違っているようにも思います。