index.php の

<?php
require('../app/functions.php');

$name = 'Taro <script>alert(1);</script>';

?>

というコードの最初の <?php を同じ意味である <?= に変更したところ、出力結果がかわりました。
なぜですか？この 2 つは完全に同じ意味ではないのですか？